全球首个!985 研究生,一作发 Nature
本文来源:华南理工大学
近日,国际顶级期刊 Nature 在线发表题为 "Cell transcriptomic atlas of the non-human primate Macaca fascicularis" 的研究论文,发布了全球首个非人灵长类动物(食蟹猕猴)全身器官百万单细胞图谱。该图谱将被用于物种进化、脑科学以及药物评价和筛选等相关研究,为生物医学的发展提供一个基础性的资源和工具,为疾病诊疗、靶向药物开发提供助力,为人类更好地探究生命的进化提供可能。
该论文的共同第一作者庄镇堃(博士生)和署名作者黄甫保钱(硕士生)均为华南理工大学生物科学与工程学院研究生,目前就读于华南理工大学 - 深圳华大生命科学研究院基因组科学创新班。论文的共同通讯作者之一、深圳华大生命科学研究院刘龙奇研究员为学校 2010 届生物技术专业校友。
庄镇堃(左)和黄甫保钱在讨论问题
据悉,该研究由深圳华大生命科学研究院联合北京华大生命科学研究院、深圳国家基因库、吉林大学、中国科学院广州生物医药与健康研究院、华南理工大学、瑞典卡罗林斯卡医学院、英国剑桥大学、西班牙 ICREA 研究所、新加坡 ASTAR 等来自 6 个国家的 35 个科研团队共同参与完成。
包含食蟹猕猴 45 个组织或器官 114 万个细胞的 " 地图 "," 地图 " 上 113 种颜色代表着 113 种细胞类型
21 世纪初,人类基因组草图的问世为生命科学的研究谱写了一本生命 " 参考书 ",为生命的数字化提供了基础。然而人类对自身细胞的认识还很有限,全面解码细胞的数字化特征将推动生命科学的研究,为生物医学的发展提供基础性的资源和工具。为此,研究人员将目光投向了非人灵长类中和人的基因相似度高达 93% 的猕猴,绘制了一张猕猴的全身器官的细胞 " 地图 ",这是世界上首个非人灵长类动物全身器官细胞图谱。
利用非人灵长类细胞图谱,研究人员找到了各个组织的共有细胞类型及其 " 特有标签 "(特异性标记基因),这对于了解这些共有细胞在不同组织里发挥不同功能提供了分子层面的证据。同时,基于该 " 地图 ",研究人员还发现了多种存在于各个组织中的具有分化潜能的细胞,这类细胞或可为之后各类器官损伤修复提供细胞来源,为哺乳动物组织再生研究提供新的思路。
基于该图谱,研究人员还构建了包含新冠、乙肝、狂犬病毒等 126 种病毒易感细胞类型的病毒数据库,这就像一本 " 病毒字典 ",可以通过它快速查询病毒最有可能侵染的细胞类型,同时看到该细胞类型可能分布的器官,为医生在检查新冠肺炎确诊患者肺部情况的同时,提供其他器官例如肾脏、胆囊等针对性检查的指导意见。
病毒易感细胞类型 " 字典 "