施一公团队近 10 年在 Nature/Cell/Science 等已发表 76 篇文章
(资料图片仅供参考)
2023 年 2 月 17 日,西湖大学施一公及张晓峰共同通讯在Nature Communications 在线发表题为 "Mechanisms of the RNA helicases DDX42 and DDX46 in human U2 snRNP assembly" 的研究论文,该研究揭示了人 U2 snRNP 组装中 RNA 解旋酶 DDX42 和 DDX46 的作用机制。该研究报道了 DDX42-SF3b 复合物的冷冻电镜结构和含有 DDX42 ( DDX42-U2 复合物 ) 的 17S U2 snRNP 的组装前体。DDX42 通过 N 端序列锚定在 SF3B1 上,其 N-plug 占据 SF3B1 的 RNA 通路。DDX42 与 SF3B1 的结合模式与 DDX46 的结合模式有着惊人的相似。
在 DDX42-U2 复合物中,DDX42 的 N 端仍然锚定在 SF3B1 上,但解旋酶结构域已被 U2 snRNA 和 TAT-SF1 取代。通过体外实验,作者发现 DDX42 和 DDX46 在与 SF3b 的结合方面是互斥的。SF3B1 的癌症驱动突变靶向 RNA 路径中直接与 DDX42 和 DDX46 相互作用的残基。这些发现揭示了 DDX42 和 DDX46 在 17S U2 snRNP 组装中的不同作用,并为 SF3B1 癌症突变的机制提供了见解。
另外,2023 年 1 月 13 日,西湖大学施一公、黄高兴宇及曾超共同通讯在Current Opinion in Structural Biology 在线发表题为 "Structure of the nuclear pore complex goes atomic" 的综述文章,该综述总结了最近在破译 NPC 分子细节方面的进展,这些进展在快速发展的冷冻电镜技术、X 射线晶体学和机器学习支持的结构预测方面得到了极大的进展。最近在冷冻电镜 ( cryo-EM ) 重建、机器学习支持的结构预测和生化重建方面的突破结合起来,以前所未有的精度生成了 NPC 的分子模型。此外,在细胞冷冻电子断层扫描 ( cryo-ET ) 结构揭示了 NPC 的实质性结构动力学。这些进步使 NPC 大的组织原则和职能更加清晰。
2023 年 1 月 2 日,西湖大学施一公团队在Cell Research(IF=46)在线发表题为 "LilrB3 is a putative cell surface receptor of APOE4" 的研究论文,该研究表明 LilrB3 是 APOE4 的假定细胞表面受体。该研究证明 APOE4,而不是 APOE2,特异性地与白细胞免疫球蛋白样受体 B3 ( LilrB3 ) 相互作用。LilrB3 胞外结构域 ( ECD ) 的两个离散免疫球蛋白样结构域识别 APOE4 的 N 端结构域 ( NTD ) 上带正电荷的表面斑块。该原子结构揭示了两个 APOE4 分子如何特异性地与两个 LilrB3 分子结合,通过形成异质四聚体复合物将它们的细胞内信号基元靠近。与生化和结构分析一致,APOE4,而不是 APOE2,以 Lilrb3 依赖的方式激活人类小胶质细胞 ( HMC3 ) 进入促炎状态。总之,该研究确定 LilrB3 可能是 APOE4 的免疫细胞表面受体,而不是 APOE2,这可能有助于理解 APOE 亚型的生物学功能和疾病相关性。
最后,iNature 编辑部结合 Pubmed 及 Web of Science 发现施一公团队从2014 年到 2023 年(截至 2023 年 3 月 23 日)在Nature (4 篇),Science (14 篇),Cell (7 篇),Cell Research (9 篇),PNAS(15 篇),Nature Communications (3 篇),Protein Cell (3 篇)及CURRENT OPINION IN STRUCTURAL BIOLOGY(5 篇)等发表76 篇文章(包括综述及研究论文,通讯作者的有 68 篇文章)(文章后附列表),专注于剪接复合物,核孔复合物及分泌酶等的结构解析。另外,由于时间匆忙,如有错误,可向编辑部反馈。
76 篇文章列表如下:
原文链接:https://www.nature.com/articles/s41467-023-36489-x
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