世界今热点:高福院士团队《柳叶刀》(IF=203) 发文:北京新冠疫情爆发期间未出现新变种
(资料图片仅供参考)
由于中国实施了国家动态清零新冠肺炎战略,2022 年 12 月之前,北京没有持续的 SARS-CoV-2 本地传播。但近 3 年来,境外输入病例频繁出现。随着近期中国新冠肺炎确诊病例的激增,人们担心可能会出现新型 SARS-CoV-2 变种。
2023 年 2 月 8 日,北京疾控中心王全意及中国科学院微生物研究所高福共同通讯在Lancet (IF=203)在线发表题为 "Characterisation of SARS-CoV-2 variants in Beijing during 2022: an epidemiological and phylogenetic analysis" 的研究论文,研究团队发现,自 2022 年 11 月 14 日以来,BF.7 和 BA.5.2 在北京爆发,目前没有证据表明出现了新的变异。
该研究共获得 2994 条完整的 SARS-CoV-2 基因组序列,其中 2881 条高质量基因组序列用于进一步分析。11 月 14 日至 12 月 20 日,共检测到 413 例新病例,其中本地病例 350 例,境外输入病例 63 例。所有这些基因组都属于现有的 123 个 Pango 谱系,表明没有持续的显性变异或新的谱系。然而,BA.5.2 和 BF.7 目前在北京占主导地位,占 11 月 14 日以来本地病例的 90%。北京市 BA.5.2 和 BF.7 有效种群规模在 2022 年 11 月 14 日后均有所增加。总之,自 2022 年 11 月 14 日以来,BF.7 和 BA.5.2 在北京爆发,目前没有证据表明出现了新的变异。
新冠肺炎大流行已持续近 3 年,仍是全球关注的问题。鉴于新冠病毒的广泛传播和不断演变,全球出现了许多变种。关注的变体 ( VOCs ) 的出现,如 Alpha ( B.1.1.7 ) 、Beta ( B.1.351 ) 、Gamma ( P.1 ) 、Delta ( B.1.617 .2 ) 和 Omicron ( B.1.1.529 ) ,引起了多次浪潮。Omicron 最早在南非被发现,并被世卫组织指定为挥发性有机化合物;它因空前数量的突变和更高的传播性,迅速接管了全球其他共同传播的变种,增加了病毒谱系的多样化。
在 2022 年 12 月之前,中国采取了与其他国家不同的疫情应对策略,从 2020 年武汉的封锁到动态清零政策、精准防控策略阻止了 SARS-CoV-2 的传播,从而在 2020 年初至 2020 年期间迅速控制了 COVID-19 的区域聚集性疫情。中国在 2022 年 12 月之前调整了防控政策,疫情在中国的快速发展引起了世界的关注,并引起了人们对此次疫情是否由新型 SARS-CoV-2 变体的出现所驱动的担忧。这凸显了在基因组水平上长期和持续监测 SARS-CoV-2 的重要性。
2022 年 11 月 14 日以后北京市 BA.5.2 和 BF.7 种群的时间动态(图源自 Lancet )
在这里,作者描述了 2022 年收集的高质量 SARS-CoV-2 全基因组序列的流行病学和系统发育。该研究共获得 2994 条完整的 SARS-CoV-2 基因组序列,其中 2881 条高质量基因组序列用于进一步分析。11 月 14 日至 12 月 20 日,共检测到 413 例新病例,其中本地病例 350 例,境外输入病例 63 例。
所有这些基因组都属于现有的 123 个 Pango 谱系,表明没有持续的显性变异或新的谱系。然而,BA.5.2 和 BF.7 目前在北京占主导地位,占 11 月 14 日以来本地病例的 90%。北京市 BA.5.2 和 BF.7 有效种群规模在 2022 年 11 月 14 日后均有所增加。总之,自 2022 年 11 月 14 日以来,BF.7 和 BA.5.2 在北京爆发,目前没有证据表明出现了新的变异。
原文链接:
https://doi.org/10.1016/S0140-6736(23)00129-0